La Corporación realiza trimestralmente estas muestras para evaluar la presencia de sustancias flotantes del agua, olor y sus características físicas de interés sanitario en varias cuencas del de la jurisdicción.
Además de esta campaña, se monitorean los afluentes de la cuenca del Río Atrato, para el cumplimiento de las actividades establecidas de la sentencia T622 del 2016 que declara al Río Atrato como Sujeto de Derechos.